В Episode Two главные герои Гордон Фримен и Аликс Вэнс просматривают видеопослание, записанное доктором Джудит Моссман — бывшим двойным агентом, работавшим как на Сопротивление, так и на Альянс. В нём Моссман, находясь на арктической базе, сообщает об обнаружении затерянного научно-исследовательского судна «Борей», на борту которого находится опасная технология, разработанная в Лаборатории исследования природы порталов.
Исходя из сюжетных поворотов второго эпизода, основные действия Half-Life 2: Episode Three, вероятнее всего, будут происходить в Арктике, где был обнаружен так называемый «Борей», на поиски которого отправляются Гордон и Аликс с целью отыскать технологию раньше, чем до неё доберётся Альянс.
По видеозаписи Мосман в Episode One, можно увидить на контейнерах, что были на корабле, знак корпорации, которая явилась игрокам в игре Portal. Поэтому можно судить что в игре возможно появиться телепорт, который использовала героиня Portal, а возможно и враги.
Корабль "Борей" был взят из реальности. Российский атомный ледокол, пропавший в арктике, имел название "Северный Ветер". В древней руси "Борей" был бог, также называемы "Северный Ветер".